Antal högskolepoäng: 7,5. Betygskala: TH. Nivå: A (Avancerad nivå). Undervisningsspråk: Kursen ges på begäran på engelska. Överlappar följande kurs/kurser: FMS160, MAS235 och MASM16. Valfri för: Pi4, Pi4bm. Kursansvarig: Studierektor Anna Lindgren, anna@maths.lth.se, Matematisk statistik. Förutsatta förkunskaper: En grundkurs i matematisk statistik samt någon kurs i stokastiska processer. Prestationsbedömning: Hemtentamen under kursens gång samt obligatorisk närvaro på laborationerna och muntlig projektredovisning. Kursbetyget utgörs till 90% av hemtentamen och 10% av projektet. Poängsatta delmoment: 2. Hemsida: http://www.maths.lth.se/matstat/kurser/fms160mas235/.

Syfte
På ett såväl teoretiskt som praktiskt sätt lära studenterna de mest grundläggande statistiska metoderna inom genetisk epidemiologi.

Mål

Kunskap och förståelse
För godkänd kurs skall studenten

• vara förtrogen med grundläggande begrepp inom genetik och molekylärbiologi, och kunna relatera dessa till matematiska modeller, speciellt inom genetisk epidemiologi

• kunna förklara de grundläggande principerna bakom kopplings- och associationsanalys, relatera metoderna till varandra och förstå deras möjligheter och begränsningar

• ha utvecklat sin förmåga att bygga på och tillämpa metoder från tidigare kurser i matematisk statistik i ett genetiskt sammanhang

Färdighet och förmåga
För godkänd kurs skall studenten

• utifrån ett datamaterial och en problemställning inom genletning, kunna välja metod, utföra beräkningarna och värdera resultatet

• kunna använda ett befintligt datorprogram/programpaket för att analysera data inom genetisk epidemiologi

• kunna muntligt presentera resultatet av en undersökning i genetisk epidemiologi

• kunna redovisa tillvägagångssätt och slutsatser vid lösning av ett problem i genetisk epidemiologi

• i skrift kunna använda statistiska termer inom ämnesområdet

• ha fått erfarenhet av att arbeta med problemlösning i en mindre grupp.

Innehåll
Kursen tar upp olika sätt för att med hjälp av statistiska metoder finna gener för ärftliga sjukdomar hos människan, dvs lokalisera deras kromosompositioner med avseende på det mänskliga genomet.

Initialt presenteras en introduktion till statistisk genetik innehållandes t.ex. grundläggande definitioner från genetikens värld. Efter detta så behandlas de olika teoretiska områdena parametrisk och icke-parametrisk kopplingsanalys samt associationsanalys.

Litteratur
Ziegler, A., König, I.: A Statistical Approach to Genetic Epidemiology. Wiley-VCH 2006. ISBN 978-3-527-31252-8

Kod: 0108. Benämning: Tentamen.
Antal Högskolepoäng: 6. Betygskala: TH. Prestationsbedömning: Skriftlig hemtentamen.

Kod: 0208. Benämning: Projekt.
Antal Högskolepoäng: 1,5. Betygskala: UG. Prestationsbedömning: Skriftlig och muntlig rapport.