Biologiska system
Biological Systems

EXTQ20, 7.5 högskolepoäng, A (Avancerad nivå)

Gäller för: 2024/25
Fakultet: Lunds tekniska högskola
Beslutad av: Programledning W
Beslutsdatum: 2024-04-02
Ikraftträdande: 2024-05-08

Allmänna uppgifter

Huvudområde: Teknik Fördjupning: Avancerad nivå, kurs/er som inte kan klassificeras
Valfri för: BME5-sbh, Pi4-biek
Undervisningsspråk: Kursen ges på begäran på engelska

Syfte

Kursen syftar till att ge kunskaper i biologiskt modelleringstänkande, både inom traditionella biologiska modelleringstekniker, men också till att ge förståelse i hur biologiskt inspirerade idéer används inom kommersiell programmering. Den ska ge insikt och träning i modellering av biologiska system från genetisk till populations- och samhällsnivå.

Ett ytterligare syfte är att ge erfarenhet i att kommunicera med biologer som saknar teknisk bakgrund.

Mål

Kunskap och förståelse
För godkänd kurs skall studenten

• ha kännedom om hur olika modelleringstekniker kan användas i olika biologiska organisationsnivåer
• ha kännedom om grundläggande begrepp som används inom modellering inom cellbiologi, fysiologi, ekologi, globala ekosystem och inom biologiskt inspirerade programmeringstekniker
• ha kännedom om modelleringstraditioner inom ovanstående områden

Färdighet och förmåga
För godkänd kurs skall studenten

• kunna tillämpa de olika modelleringsmetoder på olika system som ingår i kursen

Kursinnehåll

Temata:

• biologiska organisationsnivåer, systembiologi, molekylära nätverk
• modellering av tryck och energiflöden i hjärtat
• beteendemodeller inom dynamisk programmering
• matris- och spelteoretiska modeller på populationsnivå
• metoder inom kommersiell biologisk programmering, t ex optimering med genetiska algoritmer

Kursens examination

Betygsskala: TH - (U, 3, 4, 5) - (Underkänd, Tre, Fyra, Fem)
Prestationsbedömning: Inlämnade projektarbeten.

Om så krävs för att en student med varaktig funktionsnedsättning ska ges ett likvärdigt examinationsalternativ jämfört med en student utan funktionsnedsättning, så kan examinator efter samråd med universitetets avdelning för pedagogiskt stöd fatta beslut om alternativ examinationsform för berörd student.

Moduler
Kod: 0117. Benämning: Systembiologi.
Antal högskolepoäng: 7.5. Betygsskala: TH - (U, 3, 4, 5).

Antagningsuppgifter

Förutsatta förkunskaper: TEK290/EXTG15 Biologisk översiktskurs, FMAF05/FMA450 System och transformer, FRTF05/FRT010 Reglerteknik AK eller motsvarande kurser. Viss färdighet i Matlab (alt. programmering)
Begränsat antal platser: Nej
Kursen kan ställas in: om färre än 15 anmälda.
Kursen överlappar följande kurser: TEK292

Kurslitteratur

• Kompendium från lärarna, artiklar.

Kontaktinfo

Kursansvarig: Anders Brodin, anders.brodin@biol.lu.se
Hemsida: https://www.biologiutbildning.lu.se/biologiska-system-extq20