Kursplan för kalenderåret 2006
TEORETISK BIOFYSIKTEK267
Theoretical Biophysics

Antal poäng: 5. Betygskala: TH. Valfri för: N4. Kursansvarig: Anders Irbäck, anders@thep.lu.se, Fysiska inst (MN). Rekommenderade förkunskaper: Obligatoriska kurser inom civilingenjörsprogrammet teknisk nanovetenskap eller motsvarande. Prestationsbedömning: Muntlig tentamen och godkända inlämningsuppgifter. Övrigt: Kursen ges av naturvetenskapliga fakulteten och följer inte nödvändigtvis läsperiodsindelningen.

Mål
Den studerande skall genom utbildningen förvärva kunskap om fysikaliska frågeställningar inom biologin.

Innehåll
A. Skalning
Olika slag av likformighet: geometrisk, statisk och elastisk; dimensionslösa variabler: Buckinghams Pi-teorem; transportmekanismer i levande varelser; energiomsättning i levande varelser; olika förflyttningssätt: att gå, simma och flyga.

B. DNA, RNA och proteiner ur systemperspektiv
Från endimensionella DNA-sekvenser till tredimensionella proteiner; transkription och kodning. Storleksordningar. Extraktion av information. Bioinformatik; sekvensjämförelser och strukturförutsägelser. Genetiska nätverk.

C. Statistisk mekanik för makromolekyler
Om den tredimensionella strukturen hos proteiner och DNA. Växelverkningar och statistisk-mekaniska metoder. Sekundärstruktur och helix-coil-omvandling. Grundläggande polymerstatistik: ideala kedjor, utesluten volym och styvhet.

D. Evolution
Modeller och begrepp inom evolutionsteori. Självkatalytiska system. Komplexitet och självorganiserad kriticitet. Kvasiarter och fitnesslandskap. Populationsdynamik och punkterad jämvikt.

Litteratur
Enligt av institutionen fastställd litteraturlista, vilken ska finnas tillgänglig senast fem veckor före kursstart.